R est un logiciel opensource incontournable permettant de traiter des données et de réaliser des analyses statistiques. Sa version de base contient la plupart des fonctionnalités mais des extensions (appelées « paquets« ) sont disponible gratuitement en fonction de vos besoins (ex: courbe ROC, analyse multivariée…). R Studio et R commander sont des  interfaces graphiques pour faciliter l’utilisation de R.

R est très puissant mais aussi complexe et nécessite un investissement important en temps pour le maîtriser. Il concernera surtout les chercheurs, pour des calculs statistiques simples, vous pouvez utiliser biostaTGV.

Des sites entiers sont dédiés à l’utilisation de R. Pour ceux qui sont intéressés, voici quelques ressources qui pourront vous être utiles:

Guide

• « R pour les débutant » par E. Paradis. Il est bien fait et plutôt claire
• « R pour les Statophobes » par R. Poinsot. Rédigé avec humour mais pas totalement terminé.
• STHDA : Statistiques, Analyse de données et visualisation avec R: site internet libre
• Site internet par A. Duclert. Chapitre d’intérêt accessible en quelques clics

Vidéo

Le meilleur tutoriel est, sans hésité, celui du Pr B. Falissard issu de son MOOC

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1- Description

2- Représentations graphiques - R

3 - Mesures de position, mesures de dispersion: les principes

4 - Mesures de position et de dispersion : la pratique

5 - Intervalles de confiance

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MOOC

MOOC (Massive Open Online Courses): ce sont des cours en ligne associant vidéos, exercices, forum de discussion.

• Introduction aux statistiques avec R du Pr B. Falissard. De grande qualité !
• Effectuez vos études statistiques avec R sur Coursera. Je ne l’ai pas testé.